首先，必须是三次重复，对照和处理各三次；

其次，是进行显著性测试，或者每一个蛋白点在三次重复里的显著性P值；
    再次，是获得这个点对应的倍数关系；
    最后，根据这两个条件进行选择，选择标准是P<0.05且倍数<0.67或者>1.5倍，不同的实验室有不同的标准，可以根据各自的实验进行更改，比如按照上述标准，获得的差异点非常多，那可以把标准提高一些，反之则降低标准。